操作环境

• vmware 10
• ubuntu-14.04.2-desktop-amd64

具体操作

安装Cmake

1. 安装curses库，这个库可以让cmake运行成GUI界面，生成ccmake

sudo apt-get install libncurses5-dev
sudo apt-get install cmake-curses-gui

2. 安装cmake，这里一定要手动选择安装3.7.0的cmake，而不是apt-get install，否则会是问题很多的2.8.12

cd /home/bwb #进入你自己的目录
wget "https://cmake.org/files/v3.7/cmake-3.7.0.tar.gz"
tar zxvf cmake-3.7.0.tar.gz
cd cmake-3.7.0
sudo su #一定要加这句话root，否则下面语句会没有权限
./bootstrap && make && make install

3. 验证安装

cmake --version
ccmake --version

安装编译ITK

1. 下载4.10.1版本的ITK，需要自己用浏览器下载，因为并不是文件地址，而是一个下载服务的网页：https://sourceforge.net/projects/itk/files/itk/4.10/InsightToolkit-4.10.1.tar.gz/download。下载文件InsightToolkit-4.10.1.tar.gz放入/home/bwb

2. 建立目录，解压

cd /home/bwb
mkdir ITK
mkdir ITK/build
tar -zxvf ../InsightToolkit-4.10.1.tar.gz #把/home/bwb下的压缩文件解压到/home/bwb/ITK里

3. 编译

cd /home/bwb/ITK/build
ccmake ../InsightToolkit-4.10.1

4. 出现了GUI界面，按c键配置。然后会提示一些设置，但其实根本不用设置，注意下这两个选项是不是OFF就行，不是OFF改成OFF：

BUILD_EXAMPLES  *OFF
BUILD_TESTING   *OFF

更改的方法是，光标上下选择，回车修改，回车保存

5. 继续按c键配置，提示成功，然后按g生成编译文件。
6. make

make

测试ITK

建立目录

cd /home/bids/ITK
mkdir test       //工程文件
mkdir test/src   //存放源代码
mkdir test/bin    //示例编译目标
mkdir test/src/HelloWorld //项目名称
mkdir test/bin/HelloWorld //项目名称

拷贝官方的HelloWorld程序

cp /home/bwb/ITK/InsightToolkit-4.10.1/Examples/Installation/* /home/bwb/ITK/test/src/HelloWorld

会有两个文件：CMakeLists.txt、HelloWorld.cxx

进入bin目录，编译src的文件

cd /home/bwb/test/bin/HelloWorld
ccmake /home/bwb/ITK/test/src/HelloWorld

可能会出现错误：

ITK_DIR_NOTFOUND

同样用箭头上下选择，回车修改保存，改为ITK的目录：

/home/bwb/ITK/build

重新按c配置，按g生成编译文件

make

make   # 生成 HelloWorld 可执行文件
./HelloWrold  # 执行

最终结果：

ITK Hello World！

Helloworld的CMakeList.txt解释

#最低cmake版本要求
cmake_minimum_required(VERSION 2.8.9)
 
if(COMMAND CMAKE_POLICY)
  cmake_policy(SET CMP0003 NEW)
endif()
 
#项目名称
project(HelloWorld)
 
#ITK依赖的包的路径，include进来
find_package(ITK REQUIRED)
include(${ITK_USE_FILE})
 
#把HelloWorld.cxx源文件编译成HelloWorld可执行程序
add_executable(HelloWorld HelloWorld.cxx )
 
#指定编译参数
target_link_libraries(HelloWorld ${ITK_LIBRARIES})

安装过程中出现的坑

1. 出现undefined reference to symbol 'pthread_create'

明显是多线程模块没有正确加载。检查一下ubuntu有没有安装pthread：

bwb@ubuntu:~$ man -k pthread_create
pthread_create (3)   - create a new thread

安装了的，如果没有安装则安装：

sudo apt-get install glibc-doc
sudo apt-get install manpages-posix-dev

修改了一下CMakeLists.txt：

target_link_libraries(HelloWorld ${ITK_LIBRARIES})
改为
target_link_libraries(HelloWorld ${ITK_LIBRARIES} -lpthread)

解决了。

2. 报错undefined reference to 'itksys::SystemTools....'

没有相关的资料，唯一在google查到的资料是一段邮件对话：
他说问题在cmake：

These messages indicate possible issues with the CMake configuration.
 
For more information, see the "Configuring and Building ITK" section
of the ITK Software Guide:
 
  https://itk.org/ITKSoftwareGuide/html/Book1/ITKSoftwareGuide-Book1ch2.html#x22-130002
 
and find a downloadable HelloWorld example that includes the CMake
configuration here:
 
  https://itk.org/ITKExamples/src/Core/Common/BuildAHelloWorldProgram/Documentation.html
 
Hope this helps,
Matt

我用的2.8.12，是ITK最新版本的最低要求，所以我直接换用更高版本cmake和更低版本ITK了，才解决了，否则怎么改makefile文件都会报这个错。

参考资料

• 《Ubuntu下安装cmake，配置ITK 和 SimpleITK, VTK(已测试可执行)》
• 《ubuntu12.04 64位系统下 下安装itk和vtk》
• 《邮件对话》
• 《ubuntu 下没有pthread库 怎么办？》

ITK配准分割简明教程

• 终于找到了一本用ITK进行配准和分割的入门教程《(ITK实现 全2册)》，还是咱大成电出版的哦，写得非常详细，入门很有帮助。
• ITK官方的代码例子解释，不过是全英文的，稍微入门后可以继续看这个深入。